Depuis le 1er janvier 2019, la délégation Aquitaine est pilotée par trois instances paritaires, deux régionales et une territoriale :

- le Conseil régional stratégique et de gestion (CRSG) Nouvelle Aquitaine : instance décisionnelle chargée de définir et mettre en œuvre la politique régionale

- le Bureau régional (BR ) Nouvelle Aquitaine : instance de préparation et de suivi des décisions du CRSG

- le Comité territorial (CT) Aquitaine : instance décisionnelle sur le champ de l'examen des dossiers individuels (Congé de formation professionnelle (CFP), bilan de compétences (BC), validation des acquis de l'expérience (VAE), compte personnel de formation (CPF) et études promotionnelles (EP)).

Cette instance assure également une veille sur le champ de la formation et contribue à la définition de la politique régionale décidée par le CRSG.