L'ANFH PACA est administrée paritairement par les représentants des établissements et les organisations syndicales.
Pour l'année 2024, les instances régionales mandatées pour la région Provence-Alpes-Côte d'Azur sont :

Coordonnateur du Comité Territorial : Frédéric Limouzy (FHF)
Coordonnateur Adjoint du Comité Territorial : André Schiano (FO)

Présidente du Conseil Régional Stratégique de Gestion (CRSG) : Jessica Michel (FO)
Vice-Président du Conseil Régional Stratégique de Gestion (CRSG) : Frédéric Limouzy (FHF)